栖霞寺位于南京市东北22公里处的栖霞山上，1983年，被国务院确定为汉族地区佛教全国重点寺院。
　　栖霞寺始建于南齐永明七年(489年)。梁僧朗于此大弘三论教义,被称为江南三论宗初祖。
　　三论宗是中国佛教的宗派之一，渊源于古印度大乘佛教的中观宗，三论宗以《中论》、《十二门论》、《百论》为主要典据，由鸠摩罗什翻译，流传中国。在中国实际完成三论一宗的大业者为隋代吉藏。该宗着重阐扬诸法性空的理论，也称法性宗。该宗建立“真俗二谛”、“八不中道”等理论，认为世间万物都是以众多因缘和合而生(缘起)，离开众多因素和条件就没有独立不变的实体(性空)。一切众生智能成佛，只因迷故，为无明妄想所蒙蔽，所以成佛与否，关键在于迷悟。
　　栖霞寺历史上几易其名。最初称栖霞精舍，唐时改名功德寺、五代十国时改为妙因寺，宋代又改名为普云寺、栖霞寺、崇报寺、虎穴寺。明洪武五年(1372年)复称栖霞寺。清朝末年，太平天国与清兵作战时，栖霞寺毁于战火。1919年重建。
　　1979年修复一新，作为佛教活动场所对外开放。中国佛教协会赵朴初会长亲笔撰写了《重修栖霞寺碑文》，对栖霞寺1500年的历史作了总结和介绍。全文如下：
　　摄山栖霞寺为南朝古刹，以山多药草可以摄养故名摄山。初齐居士明僧绍隐居于此，会法度禅。师自黄龙来，讲《无量寿经》于山舍，僧绍深敬重之，因舍为寺以奉。时为齐永明七年也。后僧朗法师来自辽东，大弘三论之学，世称为江南三论之祖。僧诠、法朗诸师继之，其学益盛。先是僧绍欲于此山造佛像未果，其子仲纬继其志，与度禅师就西峰石壁造无量寿佛及二菩萨，高俱三丈有余。梁大同中，齐文惠太子与诸王又吝造大小诸佛像于千佛岩。仁寿元年，隋文帝於八十三州造舍利塔，其立舍利塔诏以蒋州栖霞寺为首。唐代寺运益隆，遂与台州国清寺、荆州玉泉寺、济州岩灵寺并称为天下四绝。
　　鉴真和尚第五次东渡未成，归途曾驻锡于此。宋元以降兴衰不一。明末清初云谷觉浪二师并加修葺。清乾隆帝五次南巡俱设行宫于栖霞，益增殊胜。太平天国以后乃趋萧条。民国初年，诗僧宗仰自金山来稍事复兴，未竟全功而殁。其后寺僧以水泥修补千佛岩，佛首涂抹失真，识者臧马。解放以来政府对此名刹甚为关注。1963年中日两国饰教文化等各界人士共同举行纪念鉴真和尚圆寂一千二百年盛大活动，日本佛教界以鉴真和尚雕像斋赠中国，奉安此寺。1666年，四凶之乱，经像法器多遭破坏，寺僧散于四方，而千佛岩之佛首又被毁殿堂赖部队保护未受摧残，鉴真像亦幸无恙。今年，中国佛教堂供奉鉴真像，以为中日世代友好之纪念。如此千年古刹今后宜如何保护盖后之责也，固略述栖霞寺之盛衰往迹以谂来者。
　　公元一千九百七十九年十二月
　　赵朴初撰并书
　　栖霞寺占地面积40多亩，共有大雄宝殿、毗卢殿、藏经楼三进院勤务，依山势层层上升，格局严整美观。
　　栖霞寺前是一片开阔的绿色草坪,有波平如镜的明镜湖和形如弯月的白莲池，四周是葱郁的树木花草，远处是蜿蜒起伏的山峰，空气清新，景色幽静秀丽。寺内主要建筑有山门、弥勒佛殿、毗卢宝殿、法堂、念佛堂、藏经楼、过海大师纪念堂、舍利石塔。寺前有明徽君碑，寺后有千佛岩等众多名胜。
　　寺前左侧有明徽君碑，是初唐为纪念明僧绍而立，碑文为唐高宗李治撰文，唐代书法家高正臣所书，碑阴“栖霞”二字，传为李治亲笔所题。此乃江南古碑之一，是珍贵文物。
　　进入山门，便是弥勒佛殿，殿内供奉袒胸露、面带笑容的弥勒佛，背后韦驮天王，昂首挺立。出殿拾级而上，是寺内的主要殿堂棗大雄宝殿，殿内供奉着高达10米的释迦牟尼佛。其后为毗卢宝殿，雄伟庄严，正中供奉高约5米的金身毗卢遮那佛，弟子梵王、帝释侍立左右，二十诸天分列大殿两侧。佛后是海岛观音塑像，观世音伫立鳌头号，善财、龙女侍女三旁，观音三十二应化身遍布全岛。堂内塑像，工艺精湛，入化传神，令人赞叹。
　　过了毗卢宝殿，依山而建的是法堂、念佛堂和藏经楼。藏经楼内珍态着汉文《大藏经》7168卷，另有各种经书1.4万余册。在佛龛中供奉着释迦牟尼玉像一尊。藏经楼左侧为“过海大师纪念堂”，堂内供奉着鉴真和尚脱纱像，陈列着鉴真和尚第六次东渡图以及鉴真和尚纪念集等文物，这些都是日本佛教界赠送的，是中日佛教界友好往来的历史见证。
　　寺内还新建了玉佛楼,正中供奉一尊高1．5米，重390公斤的玉佛像，玉佛雕凿精细，装金着彩，是台湾僧人星云捐赠的。玉佛楼两壁挂有释迦牟尼佛成道彩图。
　　寺外右侧是舍利塔,始建于隋文帝仁寿元年(601年)，七级八面，用白石砌成，高约15米。塔基四面有石雕栏杆，基座之上为须弥座，座八面刻有释迦牟尼佛的“八相成道图”，有白象投胎、树下诞生、九龙浴太子，出游西门、窬城苦修，沐浴坐解、成道、降魔和涅磐。八相图之上为第一级塔身，第一级塔身特别高，八角形，每角有倚柱，塔身刻有文殊、普贤菩萨及四大天王像等浮雕。以上各层上下檐间距离较短，五层檐由下至上逐层收入，塔身亦有收分。各面均滩两石竞，龛坐一佛。檐下斜面上还雕刻飞天、乐天、供养天人等像，与敦煌五代石窟的飞天相似。塔顶刹拄为莲花形。整个舍利塔造型精美，不仅是隋唐时期江南石雕艺术的代表作，也是研究古代佛教、艺术、文化的珍贵实物。
　　我国最大的舍利塔——南京栖霞寺舍利塔抢救维修工程于1993年底竣工。这个国家级重点文物保护景点重新对中外游客开放。由中国文物研究所副研究员蔡润主持的这次维修是历次维修中规模最大、技术水平最高的一次，主要是把数百年前由于自然风化、雷击火焚坠落的8块石构件粘结至原断口处。
　　在舍利塔后边的山岩中,还有一组南朝时期开凿的石窟,内凿佛像500余尊，称干佛崖。其中最大的佛像是无量寿佛，高达10米，左右是观音、大势至菩萨立像，组成西方三圣。周围的岩壁上迫布着佛宪和佛像，在最后一个石窟中，出现了一尊手执铁锤与铁锥的石工雕像，据说是佛像的开凿者把自己的形象也凿入佛完。干佛崖的佛像桔美壮观，反映了古代劳动人民的智慧和力量。
　　栖霞寺还是江苏省佛教协会所在地。1982年11月，中国佛教协会在这里举办了僧伽培训班。这是建国以来中国佛教界举办的第一次规模最大的培训班，有184名僧人参加，他们年龄在18-40岁之间，都具有中学文化程度。他们来自广东、江苏、上海、福建等17个省、直辖市、自治区。培训班学制一年，主要课程有佛教常识、佛教简史、戒律、丛林规制、功课唱念和文化课等。赵朴初会长前来出席开学仪式，勉励学僧“在学习上取得优异成绩，进一步继承和发扬中国佛教的优良传统，为庄严国土，利乐有情，维护祖国荣誉，增强国际友谊，争取世界和乎作贡献。”
　　1983年11月,中国佛教协会决定在南京栖霞寺成立中国佛学院栖霞山分院。1984年9月，栖霞山佛学院招收了56名学僧，他们来自19个省的43所寺庙，在这里进行了两年的学习，系统学习了佛教史、佛教三经、百法明门论、五蕴论、唯识三十论要释、戒律、语文、历史、地理、时事政策、外语等十几门课程。1986年7月，首届毕业生毕业，一部分报考中国佛学院继续深造，一部分回到原来寺庙从事寺庙教务和管理工作。