原海岛金山寺规模如此之大，影响如此之广，可寺院是何因何时被毁的呢？

　　民间有这样一种说法：明代，该寺僧侣胡作非为，造成民愤，寺院被毁。但《金史·地理志》（宋代此地属金国版图）对海岛金山寺墟址已有“瓦砾山积”的记述，说明此寺在宋代以前已经被毁。在古代，寺院被毁大多是朝廷的政府行为和战火所致，平民百姓对佛教寺院心存敬畏，特别是怕遭报应的思想相当浓重，所以平民百姓毁寺的可能性不大；即使是僧侣有不轨行为，发生惩罚报复僧侣的情况，一般也不会毁寺。

　　那么，为什么会有这种说法呢？估计与明代该县一次大的毁寺事件有关，也许是该事件的误传，导致了上述说法。明正德年间，朝内佞臣刘瑾密谋篡位，暗与该县洪恩寺住持空孟和尚勾结，藏兵300余，日夜习武操练，并修有地道机关。后事情败露，皇帝率兵亲剿，将空孟等和尚斩首，寺院被烧毁踏平。此事件该县受到株连的还有杨和尚寺、肖家寺、铁梁寺、青龙寺等寺院。

　　隋唐时期，佛教得到了巨大发展。佛教的盛行，造成了寺院经济和僧侣地位的恶性膨胀。

　　到了唐末，土地兼并加剧，赋役繁苛，人民相继流亡，许多人出家为僧或投靠寺院为寺户、佃户，以避征役。众多寺院占有大量土地、劳力，剥夺了相当多的官府所控制的纳税人口和财政收入。对此，朝廷中有的大臣深感忧虑。唐武宗即位后，愤然指出：“穷吾天下者，佛也！”

　　佛教与唐王朝在经济利益上矛盾愈发尖锐，终于引发了唐武宗大规模的禁佛毁寺事件。会昌五年七月，武宗颁发诏令，禁佛毁寺。除保留极少部分寺庙，压缩僧侣“编制”外，其余全部限期拆毁，僧尼一律还俗；田产没收，铜像钟磬熔铸钱币，铁像熔铸农器。武宗分遣御史巡行天下监督禁佛毁寺的法令执行。许多寺院僧徒平日作威作福，贫苦百姓十分憎恨，闻朝廷诏令，便纷纷涌入寺院，各地寺庙拆毁一光。

　　此事件毁大寺院4600余所、中小寺院4万多所，勒令26万僧尼还俗，15万奴婢改充两税户，没收良田数千万亩，史称“会昌废佛”。在唐王朝这一大规模的禁佛毁寺行动中，原海岛金山寺是很难幸免的，《金史·地理志》关于金山寺墟址“瓦砾山积”的记述，恰恰佐证了这一点。